20世纪80年代后期，Marshfield医学研究基金会(Marshfield Medical Research Foundation)的James和俄勒冈健康科学大学(Oregon Health Sciences University )的Wis等人分离出来一种比小卫星DNA具有更短重复单元的卫星DNA，被称为微卫星DNA，又被称作短串连重复(Short Tandem Repeats, STRs)或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSRs), 每单元长度在1~6bp之间根据重复单元的构成与分布，微卫星DNA序列被分为3种类型:单一型(pure),复合型(compound)和间断型(interrupted)