小瓮猪笼草是菲律宾棉兰老岛(Mindanao)汉密吉伊坦山(MountHamiguitan)特有的热带食虫植物。其为高地猪笼草，生长于海拔1100~1635m的地区。其种加词来源于希腊语和拉丁语，"mikros"在希腊语中意为"小的"，"amphora"在拉丁语中意为"瓮"，指其体型的矮小。2009年，沃尔克·海因里希(VolkerHeinrich)、斯图尔特·麦克弗森(StewartMcPherson)、托马斯·格罗内迈尔(ThomasGronemeyer)和维克托·阿莫路索(VictorAmoroso)对小瓮猪笼草进行了正式描述。该描述发表于斯图尔特·麦克弗森的专著《旧大陆的猪笼草(Pit