续部下学院亦称下续部学院,是拉卜楞寺的密宗学院。它的修习仪规,是根据后藏喜饶桑盖法师传续而来。主奉密宗集密、怖畏九首、胜乐、三大金刚、六臂和法王护法。设三个学级,修业年限要看每个人的勤奋程度与指挥而定。该院学僧来源,有由闻思学院中途转来的,有结业后转学的,也有一进寺庙便修习的。所以修习年限不一样。续部下学院主要教授:密宗教义、广授法师之灌顶,教化善根弟子入密宗金刚乘门。续部下学院的佛殿是整个拉卜楞寺现存唯一一座第一世嘉木样活佛时所修建的佛殿,风格古典文物众多,近300年来没有经过任何维修。续部下学院游客较少,主要供信教徒烧香朝拜许愿祈祷。现任管家为六岁既在拉卜楞寺出家的喇嘛格桑嘉措。