分子模型技术（molecular modeling technique），医学-现代医学-药学领域-药物化学-药物设计-计算机辅助药物设计-分子模型技术，一种根据实际体系，在计算机上进行的实验，通过比较模拟结果与实际体系的实验数据来检验模型的准确性，并可检验由模型导出的解析理论所做的简化近似是否成功。又称计算机模拟、计算机实验。用分子模拟不但可以模拟现实中能进行的实验过程，而且可以用来模拟、研究如分子在各种表面上的动态行为、玻璃态的分子结构、分子运动的特征、蛋白质的折叠等现代物理实验方法难以计量的物理现象与物理过程。分子模型技术最先应用于生物分子领域。20世纪70年代，由于生物分子学实验技术的进步，X射线、核磁共振（NMR）等技术的使用使研究生物分子的内部结构成为可能。此后，分子模拟被用来理解、预测、模拟蛋白质、核酸的结构和性质，以及模拟脱氧核糖核酸（DNA）的双螺旋结构。分子模型技术的方法主要有量子力学法、分子力学法、分子蒙特卡罗（Monte Carlo）法和分子动力学法四种。以上四种分子模拟方法各有特色。量子力学法能得到有关立体构型和构象能的可靠信息，可以描述电子结构的变化。