原子映射矩阵(atom mapping matrix; AMM),理学-生物学-生物工程-生物技术-生物技术-代谢工程-代谢通量,描述代谢反应中从反应物到产物的碳原子传递的数学模型。通过映射矩阵建立代谢网络中每一个代谢物的同位素标记异构体平衡方程,并结合代谢物的平衡方程建立代谢网络中同位素标记异构体分布的全局模型,进而使用参数迭代拟合的方法计算网络中代谢通量分布的方法称为基于同位素标记异构体分布模型的代谢通量分析。原子映射矩阵和同位素标记异构体映射矩阵(isotopomer mapping matrix; IMM)被用于代谢网络中同位素标记异构体分布的建模。原子映射矩阵的具体表达以丙酮酸脱氢酶催化的丙酮酸(Pyr)氧化脱羧反应生成乙酰辅酶A(AcCoA)和二氧化碳(CO2)为例,丙酮酸第一位羰基碳原子被脱去生成CO2,第二、三位碳原子分别生成乙酰辅酶A的第一、二位碳原子,其原子反应矩阵可表示为:矩阵的列数对应反应物碳原子的个数,行数对应产物碳原子的个数。 AMM和IMM均只适用于一个代谢反应中的一个代谢物和产物,对于可逆反应,会有产生两个互为转置矩阵的映射矩阵。