鼠类分类系统（Systematics of Rodentia），农学-植物保护学-农业害鼠学-害鼠生物学-鼠类分类系统，按照亲缘关系将啮齿目动物的分类名称放入适当的分类阶元里。啮齿目和兔形目一直被认为是亲缘关系最近的两个姊妹群，曾经被放入同一个目：Rodentia或者Glires。并将啮齿类作为单齿亚目（Simplicidentata），兔类作为重齿亚目（Duplicidentata）（Alston，1876；Brant，1855；Gregory，1910；Thjomas，1896；Tullberg，1899）。后来，两个分类阶元分别被提升为独立的目，但仍然作为起源关系最近的分类阶元被放入同一超目或者“同生群”（Cohort）（Landry，1974；Luckett and Hartenberger，1985；Simpson，1945）。具有影响力的啮齿类分类系统是Simpson（1945）的分类系统，他把啮齿类划分为6个亚目、15个超科、37个科。