蛋白质消化（protein digestibility），农学-畜牧学-动物营养-蛋白质营养-蛋白质代谢，将蛋白质大分子降解成为氨基酸和小肽的过程。非反刍动物和反刍动物对蛋白质消化的部位、方式不同。非反刍动物对蛋白质的消化发生在胃、小肠和大肠。蛋白质在胃中的消化由盐酸和胃蛋白酶进行。盐酸破坏蛋白质的高级结构，使蛋白质变性，暴露肽键，以利于胃蛋白酶作用。胃蛋白酶将蛋白质水解成较小分子的多肽。十二指肠是蛋白质消化的主要部位。蛋白质在小肠的消化分为肠腔内消化、膜和胞内消化。肠腔内消化主要由胰液和小肠液所含的蛋白酶完成。膜和胞内消化是蛋白质消化的最后阶段，发生在肠黏膜的外侧膜和小肠柱状上皮细胞内。大肠中蛋白质的消化主要是通过微生物的发酵作用，在微生物的发酵下，未被小肠消化吸收的蛋白质被降解生成氨，部分氨被微生物利用合成菌体，部分被肠上皮吸收，进入血液。反刍动物对蛋白质的消化发生在前胃（瘤胃、网胃、瓣胃）、真胃（皱胃）、小肠和大肠。由于瘤胃微生物的作用，使反刍动物对蛋白质的消化、利用与非反刍动物有很大差异。