部门档案馆（department archives），管理学-档案学-档案事业管理-档案局馆，国家某些特殊职能部门建立的管理本机关及其直属机关所形成的各类档案的档案管理机构。部门档案馆是国家档案馆体系中情况较为复杂的一种，是否设立部门档案馆与一个国家的档案管理体制、档案文化传统等密切相关。早在16世纪，欧洲一些国家为了国家安全保密或管理上的特定需要，开始设立部门档案馆，如外交部档案馆、海军部档案馆、陆军部档案馆、国防部档案馆等，永久管理本部门的档案，并延续至今成为一个传统。在法国、意大利、瑞典、丹麦、波兰等许多国家，除国家档案馆外，还根据某些特定机关的职能和形成档案的特殊性，单独设置了部门档案馆，如法国的外交部档案馆、国防部档案馆、铁道部档案馆，意大利的参议院档案馆、众议院档案馆、外交部档案馆、国防部档案馆，瑞典的外交部档案馆、军事档案馆，丹麦的国会档案馆、外交部档案馆、海军部档案馆、陆军部档案馆等。中国在坚持统一领导、分级管理，重点发展原有各级国家综合档案馆的原则下，根据需要建立部门档案馆。