专性病原菌（obligate pathogen），理学-生态学-微生物生态学-〔微生物与动植物、人类关系〕-专性病原菌，只能在宿主内进行繁殖和生长的病原微生物。专性病原菌不能在宿主以外的环境中进行繁殖，只能适应宿主体内比较专一的环境。因此，无法在无细胞存在的人工合成培养基上进行繁殖。专性病原菌的一个典型代表是衣原体（Chlamydia），衣原体在自然界中广泛存在，其宿主包括哺乳动物和鸟类，在宿主以外的环境中存在的衣原体不能进行生长和增殖，只有进入宿主细胞内才可以大量地繁殖子代，完成生命周期。根据专性病原菌在宿主体内存在的方式，专性病原菌可分成：①胞外专性病原菌。这类病原菌在宿主体内增殖时，不需要进入细胞内，如鼠疫巴氏杆菌（Pasteurella pestis）。②胞内专性病原菌。这类病原菌必须要进入宿主细胞内才能进行完整的增殖过程，如衣原体。