电视动画《科学超电磁炮S》改编自日本小说家镰池和马原作、漫画家冬川基作画的漫画《科学超电磁炮》，亦是电视动画《科学超电磁炮》的第2期动画。原作漫画是以轻小说《魔法禁书目录》中的人物御坂美琴为主人公而展开的故事，作为动画第二期的《科学超电磁炮S》则以漫画版“妹妹篇”剧情为主线，后半部则同第一期一样为原创剧情。2012年10月20日，在千叶暮张中心举办的“电击文库 秋之祭典2012”活动中，制作方发布了电视动画《科学超电磁炮》的第2期作品《科学超电磁炮S》的制作决定。电视动画于2013年4月12日开始播放，全24话。OVA动画《在公共浴室需要知道的重要事情（大事なことはぜんぶ銭汤に教わった）》随公式视觉书于2014年3月27日同捆推出。被称作“学园都市”的东京西部的巨大都市中，进行着超能力的开发。在此接受特殊课程而获得能力的学生被分为“无能力（Level 0）”到“超能力（Level 5）”等六个阶段，位于顶点的就是七名的“超能力（Level 5）”。其中御坂美琴是能够自由操纵电力的“电击使”中最上位的能力者，拥有“超电磁炮”异名的她是在常盘台中学就读的14岁女子中学生。