生态农业运营师实质就是管理现代工业的办法来组织现代农业的生产和经营，是全面负责生态农业产业从项目规划，产业布局到实施、产品生产、产品加工以及终端销售等多个环节的专业从业人员。它以国内外市场为导向，以提高经济效益为中心，以科技进步为支撑，围绕支柱产业和主导产品，优化组合各种生产要素，对农业和农村经济实行区域化布局、专业化生产、一体化经营、社会化服务、企业化管理，形成以市场牵龙头、龙头带基地、基地连农户，集种养加、产供销、内外贸、农科教为一体的经济管理体制和运行机制。生态农业运营师是应用农业生态系统中物种共生和物质循环再生的原理，结合系统工程的最优化办法，设计出促进分层多级利用物质的生态农业工艺系统，使生态农业工程在促进自然界良性循环的前提下，充分发挥物质的生产潜力，预防环境污染，实现经济效益和生态效益同步发展的兼具先进技术与管理职能的综合性管理人才。