水霉菌的菌丝体都是长管状而没有隔膜的菌丝,含有许多细胞核,大部分都是腐生菌,生活在水中的腐烂植物体及昆虫的尸体上;有极少数菌类能寄生在活鱼身体上。细胞壁中含有聚葡萄糖及纤维素。无性生殖时可以生成棍棒状的孢子囊;囊中分裂成许多单核游孢子﹝不经减数分裂﹞;游孢子具有两条不等长的鞭毛,其中一条较短的鞭毛上有两列绒毛在游动时指向前方;较长的一条鞭毛却指向后方。游孢子在游动一个时期后,就会收回鞭毛;孢子变成圆球形,生出细胞壁;如能沉到适当的基质上,就发芽生出芽管,而长成一株新植物。如果营养环境不良,这枚圆球形的细胞会再放出一枚新的游孢子。此种再生游孢子的形状为肾脏形,且在侧面生有两条不等长的鞭毛 ;其中