玛雅神话认为世界经历了几个时代，每个时代皆因洪水泛滥而结束。众多神灵中主要有雨神恰克及玉米神尤姆·卡克斯，还有蟾蜍形地母神、北方死神、身穿珠裙的南方女神、东方神库库尔坎和战神等。最高神灵是天神伊特萨姆纳，为祭司的保护神，也是文字和科学的创造者。玛雅神话认为世界经历了几个时代，每个时代皆因洪水泛滥而结束，今世亦将如此。起初世界处于黑暗之中，以后神创玛雅众神造了日月，用泥土造人。世界共有十三重天与九层地，地依存于巨鳄背上。时间是玛雅人宇宙观的一个重要的组成部分，认为时间就是神。对于人死后之事，看法因地区而异。尤卡坦等地的奎克人认为人死后将下到九层地狱，而拉堪顿斯人相信人死后可永远生活在地球之上的一个无劳无忧的富足之处。祭祀活动择吉日举行，礼仪隆重，献祭者要先禁食禁欲。通常的礼仪是焚香、献巴克（用蜂蜜与一种树皮酿制的饮料）、耳舌放血、献祭动物及献舞。以活人献祭只是到后期才盛行。祭司为世袭，居住在祭祀中心，分管献祭，解释经书，预告未来等。各省皆有祭司学校，高级祭司任教历史、占卜及凿刻文字等。当时玛雅宗教的体制、仪式与组织都已相当完备，并有复杂的神学。