在一个环境里保持优势的生命力和活力的细菌群叫优势菌群。在工业污染中，优势菌种是对某种特定的污染物或者特定的某种废水具有较高的去除降解效果的细菌、真菌、酵母菌、藻类等微生物。这些具有某种特定降解能力的微生物可以被污染的水、土壤或驯化好的污泥中分离、纯化而得到，或通过基因手段改造微生物以使之具有特定的降解能力。优势菌种在特定的污染环境中能够存活，它们即使不能利用污水中的污染成分做养分来源，对环境也有一定的耐受能力。优势菌种是通过人工筛选、培养和驯化，以及运用生物工程技术定向选育的，用于实际生物处理装置中的高活性单一或混合的纯培养优势微生物种群。优势菌种的筛选分离在人工固定生物活性炭技术等方面很重要，它是确保生物活性炭处理效果的关键环节。