马阮祸乱指的是明朝崇祯时期马士英、阮大铖造成的政治动乱。马士英，明朝崇祯未任凤阳总督。福王政权建立后，他以拥立之功升为内阁在学士兼兵部尚书，掌握朝政大权，并在朝中招纳贪官污吏，挟福王以令诸臣，顺我者昌，逆我者亡，专以除正人、引奸党为务。为此，他把威名卓著的史可法排斥在外，令其督师扬州，又罢除东林党人高宏图、刘宗周等；荐举奄党余孽阮大铖为兵部尚书。阮大铖入朝后，进一步引荐同党，组成奄党，横行朝中，恢复东、西厂特务机构，创制《蝗蝻录》，准备一网打尽东林党人及反对派。马士英、阮大铖还倒行逆施，破坏原有的铨选制度，公开卖官鬻爵，以贿金之多寡决定官职之大小，同时又大肆搜刮各地金银上供入己。故当时民谣讥讽马士英说：“中书随地有，都督满街走，……扫尽江南钱，填塞马家口。”马、阮在清兵步步南逼、形势日趋恶化之际，为了与宁南候左良玉争夺权力，不惜撤除江淮防线，使清兵如入无人之境，迅速攻下扬州、南京，致使福王政权垮台。对外则采取了对清妥协的态度。顺治元年（1644）七月初五日，马士英遣左懋第等向清乞和，被拒绝。南京陷落前，马士英仓皇出逃，阮大铖降清，次年马、阮先后为清廷处死。