凌云南鳅，动物界-脊索动物门-辐鳍鱼纲-鲤形目-条鳅科-南鳅属。背鳍iii-6-7；臀鳍iii-5；胸鳍i-9；腹鳍i-5-7，尾鳍分枝鳍条16。第一鳃弓内侧鳃耙6-7.脊椎骨4+35。体长为体高的6.1-8.3倍,为头长的3.9-4.4倍,为尾柄长的5.2一5.9倍,为尾柄高9.3-10.6倍,头长为吻长的1.9-2.2倍,为眼径的23.8一28倍,为眼间距的2.8-3.4倍。尾柄长为尾柄高的1.7一2.2倍。背鳍前距约为体长的45%。眼极小，仅为一小黑点，眼窝被疏松的脂肪球填充。鳔前室呈哑铃型，包于与其形状相似的骨质鳔囊中，骨质鳔囊的后壁为骨质；鳔后室退化，仅为一很小的膜质囊，前端有一细管与前室相连。生活在完全无光照的地下河流中，鲜活时皮肤无色素，半透明，隐约可见内脏器官，鳃盖红色；经褔尔马林浸泡后，全身呈乳白色，仅体侧沿侧线部分颜色较深。