核蛋白(英文:nuclear protein)，核蛋白是指在细胞质内合成， 然后运输到核内起作用的一类蛋白质。如各种组蛋白、DNA合成酶类、RNA转录和加工的酶类、各种起调控作用的蛋白因子等。核蛋白一般都含有特殊的氨基酸信号序列， 起蛋白质定向、定位作用。核蛋白为结合蛋白质中的一类。普遍存在各种生物的细胞核中的特殊形态的蛋白质，由核酸与组蛋白、精蛋白似的碱性蛋白结合而成为细胞核的主要成分。根据核酸种类的不同，分为核糖核酸核蛋白与脱氧核糖核酸核蛋白。能从细胞核中提取得到，能溶解1mol/L NaCl溶液中。核蛋白中的蛋白质包含组蛋白(或精蛋白)和非组蛋白蛋白质。组蛋白含碱性氨基酸如精氨酸和赖氨酸