原籍晋北河市梧宅乡，后迁惠安前亭村（今属后龙乡）。清道光十三年(1833年)生于穷苦的农民家庭。父亲邱柳，半农半渔，懂得一点历法、医术，人称“柳仙”。哥哥邱猴，种田烧炭为业。由于家境贫寒，邱二娘从小被卖到峰尾村当童养媳。 咸丰三年(1853年)四月，林俊在永春州起义，林杯、邱二娘也在惠北笔架山高明王宫树起义旗，开始领导贫苦农民抗捐抗税，袭击地主武装，惩办贪官污吏，得到晋(江)惠(安)仙(游)人民的热烈拥护，队伍由几百人迅速扩大到几千人。起义后不久，林杯牺牲，邱二娘高举“顺天命邱娘娘”的旗帜，继续战斗，成为义军的首领。她仿照天国军事组织，建立男营和女营，建立根据地石级小寨。清军前来“清剿”，她率义军在官溪、半岭、驿坂等地抗击，打败清兵，并在同年八月间率领义军同当时进入仙游、莆田的林俊队伍会合，声势更加壮大。清朝福建统治者曾一再惊呼“东起莆田，南至惠安，绵亘百余里……尽为贼踞”。邱二娘的义军给封建统治者以有力打击。清道光十三年(1833年)生于穷苦农民家庭。