《新疆医科大学学报》是新疆医科大学主管、主办的医学综合性学术期刊。1978年，《新疆医学院学报》创刊；1999年改名为《新疆医科大学学报》。据2018年4月《新疆医科大学学报》编辑部官网显示，《新疆医科大学学报》第四届编辑委员会拥有常务委员16人，编委107人，秘书1人。据2018年4月中国知网显示，《新疆医科大学学报》共出版文献11666篇、总被下载716775次、总被引32025次；（2017版）复合影响因子2为0.639、（2017版）综合影响因子为0.429。据2018年4月万方数据知识服务平台显示，《新疆医科大学学报》载文量为8155篇，被引量为23004次，下载量为183131次；2015年影响因子为0.76。1978年，《新疆医学院学报》创刊。