2017年4月28日 8:00 至 2017年4月30日 18:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北科产业3号楼 ·北京市海淀区丰贤中路7号举办《生物信息培训:微生物组学分析研讨班》。
培训内容
主办方介绍
生物信息培训:微生物组学分析研讨班宣传图
近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。
专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼
培训时间: 2017年4月28日-30日(报名中)
本次课程时间: 上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 上午 | 微生物组学研究的发展和挑战 | 1、微生物组研究的发展历史 2、测序平台介绍 3、基于测序的研究方法 3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组) 3.2 单个微生物de novo测序 4、应用案例分析 |
第一天 下午 | target sequencing数据分析 | 1、linux常用命令使用和上机操作 2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等) 3、target sequencing数据分析加上机 3.1质控 3.2去嵌合体 3.3 OTU聚类 3.4 注释 3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。 |
第二天 全天 | Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 | 1、质控 2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等 3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析 |
第三天 全天
| 微生物de novo测序分析 |
3、拼接组装:SPAdes等 4、基因预测 5、功能注释 6、代谢途径分析 7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移; 8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析 |
(课程内容以实际授课为准)
即将更新,敬请期待
培训费用
场馆介绍
【报名费用】 注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
【报名优惠政策】
1、3.20日前预报名的学员每人可优惠300元,
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、 同时报2个以上培训班的可额外优惠200元
5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
北科产业3号楼
北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。