中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会举办《生物信息培训:微生物组学分析研讨班》

2017年4月28日 8:00 至 2017年4月30日 18:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北科产业3号楼 ·北京市海淀区丰贤中路7号举办《生物信息培训:微生物组学分析研讨班》。

培训介绍


生物信息培训:微生物组学分析研讨班

生物信息培训:微生物组学分析研讨班宣传图

近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。

专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!

 

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼

培训时间: 2017年4月28日-30日(报名中)

本次课程时间:   上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

培训日程


日期

授课题目

授课内容

第一天

上午

微生物组学研究的发展和挑战

1、微生物组研究的发展历史

2、测序平台介绍

3、基于测序的研究方法

3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组)

3.2 单个微生物de novo测序

4、应用案例分析

第一天

下午

target sequencing数据分析

1、linux常用命令使用和上机操作

2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等)

3、target sequencing数据分析加上机

3.1质控

3.2去嵌合体

3.3 OTU聚类

3.4 注释

3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。

第二天

全天

Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析

1、质控

2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等

3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等

4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等

5、功能注释:RAMMCAP;Blast等

6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析

第三天

全天

 

微生物de novo测序分析

  1. 质控

  2. 单细胞测序去污染、去嵌合体等

3、拼接组装:SPAdes等

4、基因预测

5、功能注释

6、代谢途径分析

7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移;

8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析

(课程内容以实际授课为准)

会议嘉宾

即将更新,敬请期待

参会指南


【报名费用】  注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

【报名优惠政策】

1、3.20日前预报名的学员每人可优惠300元,

2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、 同时报2个以上培训班的可额外优惠200元               

5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

北科产业3号楼

北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。

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