北京中科资环信息技术研究院举办《高通量转录组学分析技术培训班》

2017年10月19日 8:00 至 2017年10月22日 18:00 ，北京中科资环信息技术研究院在 南京·南京金钥匙国际大酒店·玄武区中山东路534号（南京博物院南侧）举办《高通量转录组学分析技术培训班》，会议大约有40人参加。

会议通知

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高通量转录组学分析技术培训班宣传图

自从2005年高通量（NGS，新一代测序技术）技术诞生以来，短短十余年间，其发展速度日新月异。今天，高通量测序技术已经被广泛应用到生命科学研究的各个方面，目前，学习、掌握和应用最新的测序分析技术已经成为广大生命科学工作者的迫切需求。

近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从最初的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。

为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能。北京中科资环信息技术研究院特举办“高通量转录组学分析技术会议”，让参训学员了解转录组研究的实验和分析技术，掌握转录组学数据分析技术；全面的解析在研究工作中各种转录组分析流程，包括lncRNA分析，有参转录组分析、无参转录组分析、各种转录组学的延展分析。现将有关事宜通知如下：

一、主办单位: 北京中科资环信息技术研究院

会议指定协办单位：北京中科硕博研计算技术中心

二、会议时间：2017年10月19日——10月22日     南京

（时间安排：第一天报到、授课三天）

三、会议目标：

    本会议将着重以下几个方面的会议：

（1）掌握高通量测序技术发展及转录组学实验和分析技术

（2）掌握转录组学中lncRNA的研究方法

（3）学会高通量转录组测序数据的一般处理流程及评估指标

（4）学会有参转录组、无参转录组分析方法

（5）学会利用转录组学数据挖掘lncRNA的方法

（6）学会转录组学数据的延展分析方法

（7）课程提供微信群和服务器资源供学员长期讨论问题使用

四、会议对象:

各高校和科研院所从事生物信息、遗传育种、医学疾病研究、基因表达调控研究及其它相关领域教学和科研的工作者，硕士、博士研究生，以及各省市、自治区农业科技推广部门的技术人员。

五、主讲专家：

主讲专家来自著名高校及科研机构的高级专家，拥有丰富的科研及工程技术经验，具有资深的技术底蕴和专业背景。

六、会议方式: 1、课程讲座；2、专题小组研讨与案例讲解分析结合；3、实际操作

中科资环是在资源、环境等相关领域信息技术不断地发展的背景下正式成立。中科资环现今与院校和科研机构以及相关研究团队建立长期稳定的合作关系，这是中科资环持续发展重要的基础，也很好的搭建了各单位的信息互通以及相关领域合作，中科资环研究团队为推动资源、生态、环境的信息化发展提供重要的基础保障。中科资环主要致力于在资源、生态、环境等信息领域的软件系统研发、项目合作、技术咨询、技术推广以及国内外相关主导软件代理等。中科资环已经组建完成生物、（水、大气）环境、农业、3s技术等领域信息发展中心。为更好的服务于各单位，中科资环成立环境系统模拟事业部、以及教育中心。中科资环下设各中心聘请多位教授、研究员等成为各中心的长期顾问专家，大幅度提高了中科资环的科研实力。

会议日程 （最终日程以会议现场为准）

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会议时间：2017年10月19日——10月22日     南京

（时间安排：第一天报到、授课三天）

方式	课程	内容
讲课	第1章 高通量测序技术发展及转录组学实验和分析技术	通过对测序原理的讲解，理解测序仪的特点以及各种建库操作对于样本的影响进而设计有针对性的高通量测序实验，同时讲解三代测序，光学图谱，Hi-C等实验技术原理，了解最新技术对于高通量重测序实验的作用；转录组研究的实验和分析技术介绍； 测序技术发展史 高通量测序基本知识及原理 主流测序技术的比较（一代，二代，三代，光学图谱，Hi-C） 转录组技术发展前沿动态 转录组学研究的实验技术 转录组技术流程及技术细节（重点讲解） 常用的转录组测序建库技术
讲课	第2章 转录组学中lncRNA的研究	lncRNA目前的定义、应用和发展 lncRNA的生物学过程（重点讲解） lncRNA的测序（重点讲解） lncRNA测序数据分析案例展示（重点讲解）
讲课 实操	第3章 De novo 转录组数据分析上机实践	讲解生物信息学服务器的基本操作技术及编程语言的特点，进一步的理解转录组学分析的相关参数，掌握de novo 转录组的操作流程； 生物信息学服务器操作基础 Linux概述（上机操作） 集群服务器 python语言 如何学习语言 原始数据的检测和预处理（上机实操） 使用Trinity拼接转录组数据（上机实操） 原始数据与拼接转录本的比对（上机实操） 表达量统计和差异表达分析（上机实操） 使用blast对转录本进行功能注释（上机实操） 寻找转录本的ORF，翻译蛋白质序列
实操	第4章 Reference based转录组数据分析上机实践（一）	掌握带参考基因组的转录组分析流程； 转录组数据准备和软件介绍 使用Tophat进行转录组数据的比对（上机实操） 用IGV查看比对结果 使用cufflinks进行表达量估计和分析（上机实操） 使用samtools检测转录组数据中的突变（上机实操） 利用DAVID数据库进行差异表达基因的功能分析（上机实操）
实操	第5章 Reference based转录组数据分析上机实践（二）	系统讲解lncRNA分析的步骤及原理，理解不同步骤的参数设置，实际操作一套lncRNA挖掘流程，真正理解lncRNA分析方法及实际功能意义； 利用tophat和cufflinks组合，预测转录本 使用CNCI预测新的lncRNA转录本（上机实操） 使用LncTar软件预测lncRNA调控的靶基因（上机实操）
讲课 实操	第6章 转录组延展分析	了解转录组分析案例，理解转录组如何才能挖掘的更深更透；掌握一些转录组学的延展分析思路及方法。 转录组应用案例及应用热点； 共表达基因计算及共表达网络构建（上机实操）； 转录组多样品聚类分析（上机实操）； 转录组多样品K-means聚类分析（上机实操）；

会议嘉宾

即将更新，敬请期待

参会指南

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培训费用：

3600元（报名费、培训费、资料费、午餐费）住宿可统一安排，费用自理。

（发票可开具类型：培训费、会议费、资料费）

注：凡参会学员赠送8G优盘，内附软件以及相关教材辅助学习资料！

 

内训流程简介：

了解企事业单位的会议需求→电话访谈或面谈，诊断需求→提交/修改会议解决方案→签订培 训合作协议→会议实施→会议效果评估→会议效果跟踪与回访。

如有相关单位对内训有需求或感兴趣的老师，您可以详细来电咨询！

 

报名方式：

请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加会议，各单位也可直接报名参加。。

注：为保证授课质量，本次会议额定40人以内，如有意向参加，请及时报名。

交通指南：

玄武区中山东路534号（南京博物院南侧）

南京金钥匙国际大酒店共有客房总数123间（套），标间面积25平米。酒店位于南京市中山东路534号，地处中山陵文化风景区，面对著名的南京博物院，紧邻600年悠久历史的明城墙——中山门，距南京禄口国际机场30分钟车程，距市中心新街口广场仅2公里，风景幽雅，交通便利。南京金钥匙国际大酒店以特有的六朝文化特色装修更是丰富了酒店的文化内涵，独特精心的装修令您赏心悦目。酒店内饰传承东吴、东晋、南朝、明朝、太平天国、民国、浓郁的六朝风格，充分体现了中国文化的精髓，尽显南京十朝都会之风情。感知六朝，把脉现代，聆听酒店与历史对话，享受酒店用“心”的服务