2017年11月27日 8:00 至 2017年11月30日 18:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北京市计算中心·海淀区丰贤中路7号举办《实用微生物组学信息分析精品班》。
会议内容
主办方介绍
实用微生物组学信息分析精品班宣传图
为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训地点:
北京海淀区丰贤中路
7号3号楼,北京市计算中心三层会议室培训时间:
2017年11月27日-30日 (报名中)
上午:
9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。
日期 | 上课时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 9:30-12:00 | 微生物组学研究概论及进展 | 1、微生物组研究的发展历史 2、微生物测序分析技术及实验技术原理 3、研究热点分享 |
13:30-17:30 | 经典案例分享和方案设计与文章架构设计 | 1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向 2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 | |
第二天 | 9:00-12:00 | Linux基础操作 | 1、Linux常用命令使用和上机操作 2、Linux环境下软件安装 |
16s测序分析结果解读 | 1、OUT分析 2、物种分类与丰度分析 3、Alpha多样性分析 4、Beta多样性分析 5、显著性差异分析 | ||
13:30-17:30 | 16s数据分析 (上机) | 1、质控与数据拼接 2、OTU聚类 3、物种注释 4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。 | |
第三天 | 9:00-12:00 | 宏基因组测序分析结果解读 | 1、物种注释分析 2、差异物种分析 3、差异基因分析 4、功能注释分析 5、MGS分析 |
13:30-17:30 | 宏基因组数据分析(上机) | 1、质控 2、拼接组装 3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析 | |
第四天 | 9:00-12:00 | R的数据处理功能及统计应用 | 1、R的安装、运行与使用 2、R语法介绍(R基本符号) 3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围 |
13:30-17:30 | R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用 | 1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存) 2、图形案例实际操作 2.1散点图-点线混合图、并列散点图、坐标对数话 2.2条形图-标准条形图、推积条形图Error Bar形图 2.3饼图 2.4盒形图(箱线图) 2.5频率直方图 2.6热图 |
(课程内容以实际授课为准
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讲师团队
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邀请中科院、北大、军科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
会议门票
场馆介绍
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报名费用
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培训费:
5000元
/
人(材料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用) 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
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报名优惠政策
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1、10.31日前报名成功并缴费每人可优惠300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
老学员参加及老学员推荐参加的学员均可额外优惠
200元。? 培训座位按收到报名表先后顺序安排。
北京市计算中心
北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献