2018年1月17日 8:00 至 2018年1月19日 18:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北科产业3号楼 ·北京市海淀区丰贤中路7号举办《生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班》。
会议内容
主办方介绍
生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班宣传图
Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2018.1.17-19(报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00
【培训特色】
1、对口生物信息; 2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 概述 | 1. 生物信息学数据处理概述; 2. Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围 |
运行调试 | 3. Perl语言解释器、编辑器安装; 4. Perl运行环境测试与程序编写; 5. UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理; 6. 基于宏的perl语言快速编程 | |
操作基础 | 7. Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构; 8. Perl语言常用函数的功能应用; 9. 生物学数据文件的读入与输出; 10. 生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等; 11. 批量自动化数据文件操作 | |
第二天 | 生物信息实例应用 | 12. 常用生物信息学数据文件格式简介; 13. 用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列; 14. 用perl进行生物学数据文件格式转化; 15. 用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息; 16. 用perl批量自动化下载基因序列; 17. 用perl进行DNA到protein批量翻译; 18. 用perl批量DNA序列反向互补; |
高级数据处理 | 19. Perl语言的数组、二维数组、hash表用法; 20. 用perl自动化从表格数据提取信息; 21. 矩阵数据文件的生成与应用 22. 二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用 | |
第三天 | 模块与子程序 | 23. perl子程序与模块应用; 24. 强大的正则表达式的应用; 25. 用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计; |
Perl的高级应用 | 26. Perl第三方代码库CPAN的简介与应用; 27. Bioperl模块与应用; 28. 常用生物信息学程序实例; 29. 用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析; 30. 基于perl的circos基因组作图工具介绍; |
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
即将更新,敬请期待
会议门票
场馆介绍
【报名费用】
注册费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社
北科产业3号楼
北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。