2018年6月11日 9:30 至 2018年6月14日 17:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北科产业3号楼 ·北京市海淀区丰贤中路7号举办《2018实用微生物组学信息分析精品班》。
会议内容
主办方介绍
2018实用微生物组学信息分析精品班宣传图
为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:2018年6月11-14日(报名中) 上午:9:00 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
讲师团队:邀请中科院、北大、军科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。
日期 | 上课时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 9:30-12:00 | 微生物组学研究概论及进展 | 1、微生物组研究的发展历史 2、微生物测序分析技术及实验技术原理 3、研究热点分享 |
13:30-17:00 | 经典案例分享和方案设计与文章架构设计 | 1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向 2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 | |
第二天 | 9:00-12:00 | Linux基础操作 | 1、Linux常用命令使用和上机操作 2、Linux环境下软件安装 |
16s测序分析结果解读 | 1、OUT分析 2、物种分类与丰度分析 3、Alpha多样性分析 4、Beta多样性分析 5、显著性差异分析 | ||
13:30-17:00 | 16s数据分析 (上机) | 1、质控与数据拼接 2、OTU聚类 3、物种注释 4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。 | |
第三天 | 9:00-12:00 | 宏基因组测序分析结果解读 | 1、物种注释分析 2、差异物种分析 3、差异基因分析 4、功能注释分析 5、MGS分析 |
13:30-17:00 | 宏基因组数据分析(上机) | 1、质控 2、拼接组装 3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析 | |
第四天 | 9:00-12:00 | R的数据处理功能及统计应用 | 1、R的安装、运行与使用 2、R语法介绍(R基本符号) 3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围 |
13:30-17:00 | R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用 | 1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存) 2、微生物组学数据结果制作案例实际操作 |
即将更新,敬请期待
会议门票
场馆介绍
培训费:5000元/人(材料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
【报名优惠政策】
1、4月班3.30日,6月班5月20日前报名成功并缴费每人可优惠300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额;
培训座位按收到报名表先后顺序安排。
北科产业3号楼
北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。