中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会举办《2018生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题

2018年7月30日 9:30 至 2018年8月1日 17:00 ，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北京市计算中心·海淀区丰贤中路7号举办《2018生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班》。

会议通知

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2018生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班宣传图

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员，且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加！

主办单位：

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 

承办单位：

北京市计算中心 

协办单位：

云计算关键技术与应用北京市重点实验室 

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 

中国生物工程杂志 

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

北京微生太科技有限公司

北京依托华茂生物科技有限公司

举办地：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼 

培训时间：2018.7.30-8.1（报名中）上午9：30-12：00，下午13：30-17：00

【培训特色】 

1、对口生物信息；   

2、非严格语法，适合初学； 

3、功能强大、跨平台；

4、有巨大的第三方代码库CPAN

中国生物工程学会（Chinese Society of Biotechnology，CSBT）成立于1993年，首任理事长：谈家桢院士，现任理事长：高福院士。中国生物工程学会成立以来，主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动，为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

会议日程 （最终日程以会议现场为准）

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日期	授课题目	授课内容
第一天	概述	1.    生物信息学数据处理概述； 2.    Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围
	运行调试	3.    Perl语言解释器、编辑器安装； 4.    Perl运行环境测试与程序编写； 5.    UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理； 6.    基于宏的perl语言快速编程
	操作基础	7.    Perl语言基本变量、操作符、判断结构；循环结构； 8.    Perl语言常用函数的功能应用； 9.    生物学数据文件的读入与输出； 10.  生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等； 11.  批量自动化数据文件操作
第二天	生物信息实例应用	12.  常用生物信息学数据文件格式简介； 13.  用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列； 14.  用perl进行生物学数据文件格式转化； 15.  用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息； 16.  用perl批量自动化下载基因序列； 17.  用perl进行DNA到protein批量翻译； 18.  用perl批量DNA序列反向互补；
	高级数据处理	19.  Perl语言的数组、二维数组、hash表用法； 20.  用perl自动化从表格数据提取信息； 21.  矩阵数据文件的生成与应用 22.  二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用
第三天	模块与子程序	23.  perl子程序与模块应用； 24.  强大的正则表达式的应用； 25.  用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计；
	Perl的高级应用	26.  Perl第三方代码库CPAN的简介与应用； 27.  Bioperl模块与应用； 28.  常用生物信息学程序实例； 29.  用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析； 30.  基于perl的circos基因组作图工具介绍；

 

会议嘉宾

即将更新，敬请期待

参会指南

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【报名费用】 

注册费4000元/人，含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社 

【报名优惠政策】 

1、7.10日前报名并缴费，可享受减免200元优惠； 

2、3人以上团体报名每人可减少200元； 

3、4+1团报，可免费赠送一个名额                

4、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。 

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。 

【注】开课前一周会发送邮件通知，若未接到邮件通知，请电话咨询

北京市计算中心建立于一九七三年，是国内最早一批计算中心之一，是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构，服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来，完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、，拥有了200余项国际国内领先的技术和产品，为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献