2018年8月20日 9:30 至 2018年8月22日 17:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北京市计算中心·海淀区丰贤中路7号举办《2018基因组关联分析技术应用培训班》。
会议内容
主办方介绍
2018基因组关联分析技术应用培训班宣传图
以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。
举办地点
:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
培训时间
:
2018.8.20-22上午9:30-12:00,下午13:30-17:00【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 基因组关联分析理论基础 | 1、 基因组学与生物信息学概述; 2、 基于群体遗传的数据获取; 3、 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍; 4、 常用GWAS数据库介绍; |
Plink软件基础应用 | 5、 Plink软件应用; 6、 Plink文件格式生成与解析; 7、 等位基因频率计算; 8、 哈-温平衡计算; 9、 目标区域数据提取; 10、 基因组关联分析流程; 11、 关联分析结果分析与p校正; | |
第二天 | 基因型填充Imputation | 12、 基因型填充Imputation的原理及应用; 13、 Beagle软件介绍与应用; 14、 基因组填充的方法与分析流程; 15、 1000G数据应用 |
Plink软件进阶应用 | 16、 基于家系的关联分析; 17、 曼哈顿图的绘制与结果展示; 18、 SNP位点的condition分析; 19、 Meta gwas数据分析; | |
第三天 | Haploview软件 | 20、 Haploview软件应用; 21、 Haplotype单倍型分析; 22、 LD连锁不平衡指数计算; 23、 SNP marker之间的r2、D值等计算; |
Tassel软件 | 24、 Tassel软件应用; 25、 Tassel基于命令行的批量数据分析; 26、 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等; |
即将更新,敬请期待
会议门票
场馆介绍
【报名费用】注册费:4000元/人(含听课费、资料费(材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。)、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
【报名优惠政策】
1、7.20日前报名并缴费,可享受减免200元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请咨询客服
北京市计算中心
北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献