百山祖短肠蕨，蕨类植物门-蕨纲-薄囊蕨亚纲-真蕨目-蹄盖蕨科-短肠蕨属-长盖组-二回羽叶亚组-卵形系。能育叶长达80厘米；叶柄长达33厘米，直径1-2毫米，禾秆色，基部略被鳞片；鳞片褐色，披针形或线形，全缘；叶片卵状三角形，长达45厘米，宽达30厘米，顶部渐尖，基部近平截，羽裂渐尖的顶部以下一回羽状一羽片深裂或基部近二回羽状；侧生羽片达10对，互生或近对生，略斜展，下部的矩圆披针形，基部略呈心形，柄长达1厘米，上部的披针形，基部阔楔形，无柄或有短柄，基部1对较大，长达20厘米，宽达7厘米，羽状深裂至全裂，其中部下侧裂片较长；裂片矩圆形或卵状矩圆形，先端钝圆，边缘有圆钝齿，有时浅羽裂；叶脉上面略可见，下面明显，在侧生羽片的裂片上小脉达10对，单一或二叉，有时羽状。叶干后近膜质，绿色，上面色较深，光滑，下面略有褐色小鳞片。孢子囊群短线形，大多单生于小脉中部；囊群盖褐色，膜质，全缘。